MOLEKBASE: uporabnikom prijazen sistem za hranitev, izbiro in pretvorbo molekulskih podatkov v populacijski genetiki

Avtorji

  • Marjana Westergren
  • Hojka Kraigher

Ključne besede:

populacijska genetika, baza molekulskih podatkov, izbira podatkov

Povzetek

Molekulski podatki za genetske analize populacij so pogosto shranjeni v obliki razpredelnic ali kot vhodni podatki za programe, ki omogočajo njihovo analizo. Take podatke lahko pogosto interpretira le raziskovalec, ki je poskus izvajal, kar vodi k manjši transparentnosti celotne raziskave. Pogosto se tako shranjeni podatki nahajajo na več lokacijah. Sprememba v podatkih na eni lokaciji vnese v set podatkov nedoslednosti. Razvili smo matrico baze za transparentno hranitev populacijskih molekulskih podatkov na enotni lokaciji v programu Access in pripravili program za izbiro ter pretvorbo podatkov v format, ki ga prepoznajo programi za analize v okviru populacijske genetike Genepop, SpaGeDi, Structure, Baps in Convert. Novo razviti sistem MOLEKBASE je prosto dostopen na http://www.gozdis.si/index.php?id=151.

Objavljeno

2014-01-15

Številka

Rubrike

Articles